ทั้งนี้โรงพยาบาลศูนย์การแพทย์มหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวง ตั้งอยู่ ตำบลนางแล อำเภอเมืองเชียงราย จังหวัดเชียงราย เป็นโรงพยาบาลขนาด 400 เตียง เป็นอาคารสูง 15 ชั้น มีพื้นที่ใช้สอย 100,000 ตารางเมตร เริ่มก่อสร้างเมื่อเดือนตุลาคม 2557 ด้วยเงินงบประมาณประมาณ 2,800 ล้านบาท การก่อสร้างแล้วเสร็จในเดือนสิงหาคม 2561 พร้อมเปิดให้บริการรักษาเบื้องต้นแก่ประชาชนในพื้นที่และใกล้เคียง ก่อนจะขยายไปสู่การรักษาระดับสูงต่อไป โดยโรงพยาบาลศูนย์การแพทย์มหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวง เป็นส่วนหนึ่งของสำนักวิชาแพทยศาสตร์ ที่ใช้ทั้งการเรียนการสอนของนักศึกษาแพทยศาสตร์และตรวจรักษาผู้ป่วยทั่วไปในทุกโรค
สำหรับโรงพยาบาลมหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวงเดิม ที่ตั้งอยู่ในพื้นที่ของมหาวิทยาลัย ตำบลท่าสุด อำเภอเมืองเชียงราย จังหวัดเชียงราย จะปรับเปลี่ยนเป็นโรงพยาบาลแพทย์ทางเลือก เช่น คลินิกแพทย์แผนไทย คลินิกแพทย์แผนจีน คลินิกผิวหนังและเวชศาสตร์ชะลอวัย บริการศัลยกรรมตกแต่ง คลินิกกายภาพบำบัด ศูนย์บริบาลผู้สูงอายุ แบบรายวันและรายเดือน โครงการบ้านเด็กเล็ก ห้องออกกำลังกาย การจำหน่ายอาหารสุขภาพ ศูนย์จำหน่ายผลิตภัณฑ์ดูแลผิว และจัดจำหน่ายผลิตภัณฑ์สุขภาพจากผลงานวิจัยของมหาวิทยาลัย และงานพยาบาลผู้ป่วยใน